カーオーディオを良くするには

ユニット(プレーヤー)自体の良し悪しも大切ですけど、トヨタでもカーオーディオ専門店でスピーカーを交換するだけでも結構印象が変わると思いますよ

あとは、例えばフロントにしかスピーカーが無いならリアにも追加するとか。
同じ車種でもグレードの上下によっては、取り付けスペースは有るものの実はスピーカーは中に入ってない…とかあるので

それと、スピーカーを交換しないにしてもデッドニングをして、内装類の余計な振動を抑えるだけでも効果有りだと思います。←低音の聴こえ具合がボヤけなくなる

高機能・高音質を求め出したらキリがないですけど、純正&ショボいユニットからの交換なら、
*ipod等ポータブルプレーヤーを繋げられる端子がユニット前面にあること
*音質調整がある程度出来ること
*イルミの色が内装の照明色と合っていること(もしくは好みの色に変えられる)

ウーファーやアンプの追加までは求めてないので、個人的にはこの辺が条件です

ユニットのデザインや操作性は個人の好みがありますからねぇ…。